pandas: filtro complejo en filas de DataFrame


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Me gustaría filtrar filas por una función de cada fila, por ejemplo

def f(row):
  return sin(row['velocity'])/np.prod(['masses']) > 5

df = pandas.DataFrame(...)
filtered = df[apply_to_all_rows(df, f)]

O para otro ejemplo más complejo y artificial,

def g(row):
  if row['col1'].method1() == 1:
    val = row['col1'].method2() / row['col1'].method3(row['col3'], row['col4'])
  else:
    val = row['col2'].method5(row['col6'])
  return np.sin(val)

df = pandas.DataFrame(...)
filtered = df[apply_to_all_rows(df, g)]

¿Como lo puedo hacer?

Respuestas:


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Puede hacer esto usando DataFrame.apply, que aplica una función a lo largo de un eje dado,

In [3]: df = pandas.DataFrame(np.random.randn(5, 3), columns=['a', 'b', 'c'])

In [4]: df
Out[4]: 
          a         b         c
0 -0.001968 -1.877945 -1.515674
1 -0.540628  0.793913 -0.983315
2 -1.313574  1.946410  0.826350
3  0.015763 -0.267860 -2.228350
4  0.563111  1.195459  0.343168

In [6]: df[df.apply(lambda x: x['b'] > x['c'], axis=1)]
Out[6]: 
          a         b         c
1 -0.540628  0.793913 -0.983315
2 -1.313574  1.946410  0.826350
3  0.015763 -0.267860 -2.228350
4  0.563111  1.195459  0.343168

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No es necesario applyen esta situación. Un índice booleano normal funcionará bien. df[df['b] > df['c']]. Hay muy pocas situaciones que realmente lo requieran applye incluso pocas que lo necesiten conaxis=1
— Ted Petrou

@TedPetrou ¿Qué sucede si no está seguro de que todos los elementos de su marco de datos sean del tipo correcto? ¿Un índice booleano regular admite el manejo de excepciones?
— D. Ror.

13

Supongamos que tengo un DataFrame de la siguiente manera:

In [39]: df
Out[39]: 
      mass1     mass2  velocity
0  1.461711 -0.404452  0.722502
1 -2.169377  1.131037  0.232047
2  0.009450 -0.868753  0.598470
3  0.602463  0.299249  0.474564
4 -0.675339 -0.816702  0.799289

Puedo usar sin y DataFrame.prod para crear una máscara booleana:

In [40]: mask = (np.sin(df.velocity) / df.ix[:, 0:2].prod(axis=1)) > 0

In [41]: mask
Out[41]: 
0    False
1    False
2    False
3     True
4     True

Luego use la máscara para seleccionar del DataFrame:

In [42]: df[mask]
Out[42]: 
      mass1     mass2  velocity
3  0.602463  0.299249  0.474564
4 -0.675339 -0.816702  0.799289

2
en realidad, este fue probablemente un mal ejemplo: np.sinse transmite automáticamente a todos los elementos. ¿Qué pasa si lo reemplazo con una función menos inteligente que solo pueda manejar una entrada a la vez?
— Dudoso


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No puedo comentar sobre la respuesta de Duckworthd , pero no funciona perfectamente. Se bloquea cuando el marco de datos está vacío:

df = pandas.DataFrame(columns=['a', 'b', 'c'])
df[df.apply(lambda x: x['b'] > x['c'], axis=1)]

Salidas:

ValueError: Must pass DataFrame with boolean values only

Para mí, parece un error en pandas, ya que {} es definitivamente un conjunto válido de valores booleanos. Para obtener una solución, consulte la respuesta de Roy Hyunjin Han .


3

El mejor enfoque que he encontrado es, en lugar de usarlo reduce=Truepara evitar errores para df vacío (ya que este argumento está obsoleto de todos modos), simplemente verifique que df size> 0 antes de aplicar el filtro:

def my_filter(row):
    if row.columnA == something:
        return True

    return False

if len(df.index) > 0:
    df[df.apply(my_filter, axis=1)]

0

Puede usar la locpropiedad para dividir su marco de datos.

Según documentación , locpuede tener callable functioncomo argumento.

In [3]: df = pandas.DataFrame(np.random.randn(5, 3), columns=['a', 'b', 'c'])

In [4]: df
Out[4]: 
          a         b         c
0 -0.001968 -1.877945 -1.515674
1 -0.540628  0.793913 -0.983315
2 -1.313574  1.946410  0.826350
3  0.015763 -0.267860 -2.228350
4  0.563111  1.195459  0.343168

# define lambda function
In [5]: myfilter = lambda x: x['b'] > x['c']

# use my lambda in loc
In [6]: df1 = df.loc[fif]

si desea combinar su función de filtro fifcon otros criterios de filtro

df1 = df.loc[fif].loc[(df.b >= 0.5)]
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