Trazar un cubo 3d, una esfera y un vector en Matplotlib


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Busco cómo trazar algo con menos instrucción posible con Matplotlib pero no encuentro ninguna ayuda para esto en la documentación.

Quiero trazar las siguientes cosas:

  • un cubo de estructura alámbrica centrado en 0 con una longitud de lado de 2
  • una esfera de "estructura alámbrica" ​​centrada en 0 con un radio de 1
  • un punto en las coordenadas [0, 0, 0]
  • un vector que comienza en este punto y va a [1, 1, 1]

¿Como hacer eso?


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También echa un vistazo a mayavi2 . Es un poco dependiente, pero tiene algunos comandos de alto nivel realmente impresionantes. Puedo armar una respuesta más detallada basada en ese paquete si lo deseo. . .
meawoppl

Respuestas:


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Es un poco complicado, pero puedes dibujar todos los objetos con el siguiente código:

from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
from itertools import product, combinations


fig = plt.figure()
ax = fig.gca(projection='3d')
ax.set_aspect("equal")

# draw cube
r = [-1, 1]
for s, e in combinations(np.array(list(product(r, r, r))), 2):
    if np.sum(np.abs(s-e)) == r[1]-r[0]:
        ax.plot3D(*zip(s, e), color="b")

# draw sphere
u, v = np.mgrid[0:2*np.pi:20j, 0:np.pi:10j]
x = np.cos(u)*np.sin(v)
y = np.sin(u)*np.sin(v)
z = np.cos(v)
ax.plot_wireframe(x, y, z, color="r")

# draw a point
ax.scatter([0], [0], [0], color="g", s=100)

# draw a vector
from matplotlib.patches import FancyArrowPatch
from mpl_toolkits.mplot3d import proj3d


class Arrow3D(FancyArrowPatch):

    def __init__(self, xs, ys, zs, *args, **kwargs):
        FancyArrowPatch.__init__(self, (0, 0), (0, 0), *args, **kwargs)
        self._verts3d = xs, ys, zs

    def draw(self, renderer):
        xs3d, ys3d, zs3d = self._verts3d
        xs, ys, zs = proj3d.proj_transform(xs3d, ys3d, zs3d, renderer.M)
        self.set_positions((xs[0], ys[0]), (xs[1], ys[1]))
        FancyArrowPatch.draw(self, renderer)

a = Arrow3D([0, 1], [0, 1], [0, 1], mutation_scale=20,
            lw=1, arrowstyle="-|>", color="k")
ax.add_artist(a)
plt.show()

output_figure


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Para dibujar solo la flecha, hay un método más fácil: -

from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
import matplotlib.pyplot as plt
fig = plt.figure()
ax = fig.gca(projection='3d')
ax.set_aspect("equal")

#draw the arrow
ax.quiver(0,0,0,1,1,1,length=1.0)

plt.show()

carcaj se puede utilizar para trazar múltiples vectores de una sola vez. El uso es el siguiente: - [de http://matplotlib.org/mpl_toolkits/mplot3d/tutorial.html?highlight=quiver#mpl_toolkits.mplot3d.Axes3D.quiver]

carcaj (X, Y, Z, U, V, W, ** kwargs)

Argumentos:

X, Y, Z: las coordenadas x, y y z de las ubicaciones de las flechas

U, V, W: Las componentes x, y y z de los vectores flecha

Los argumentos pueden ser escalares o parecidos a una matriz.

Argumentos de palabras clave:

longitud: [1.0 | flotar] La longitud de cada carcaj, por defecto a 1.0, la unidad es la misma con los ejes

arrow_length_ratio: [0.3 | flotar] La proporción de la punta de la flecha con respecto al carcaj, por defecto a 0.3

pivote: ['cola' | 'medio' | 'tip'] La parte de la flecha que está en el punto de la cuadrícula; la flecha gira sobre este punto, de ahí el nombre pivote. El valor predeterminado es 'cola'

normalizar: [Falso | Verdadero] Cuando es Verdadero, todas las flechas tendrán la misma longitud. Este valor predeterminado es Falso, donde las flechas tendrán diferentes longitudes dependiendo de los valores de u, v, w.


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Mi respuesta es una combinación de los dos anteriores con extensión a la esfera de dibujo de opacidad definida por el usuario y alguna anotación. Encuentra aplicación en la visualización de vectores b en una esfera para imágenes de resonancia magnética (IRM). Esperamos que te sea útil:

from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np

fig = plt.figure()
ax = fig.gca(projection='3d')

# draw sphere
u, v = np.mgrid[0:2*np.pi:50j, 0:np.pi:50j]
x = np.cos(u)*np.sin(v)
y = np.sin(u)*np.sin(v)
z = np.cos(v)
# alpha controls opacity
ax.plot_surface(x, y, z, color="g", alpha=0.3)


# a random array of 3D coordinates in [-1,1]
bvecs= np.random.randn(20,3)

# tails of the arrows
tails= np.zeros(len(bvecs))

# heads of the arrows with adjusted arrow head length
ax.quiver(tails,tails,tails,bvecs[:,0], bvecs[:,1], bvecs[:,2],
          length=1.0, normalize=True, color='r', arrow_length_ratio=0.15)

ax.set_xlabel('X-axis')
ax.set_ylabel('Y-axis')
ax.set_zlabel('Z-axis')

ax.set_title('b-vectors on unit sphere')

plt.show()

por favor, explique [0:2*np.pi:50j, 0:np.pi:50j]cómo funcionará este segmento. ¿Cuál es el radio y el centro de la esfera en términos analíticos?
Ragnar
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