PyQt si está desarrollando algo serio, especialmente porque las cosas que aprende se traducirán directamente en trabajar con Qt en otros idiomas también si alguna vez lo necesita, y Qt es probablemente el mejor kit de herramientas de interfaz multiplataforma disponible en este momento.
Solo hay dos desventajas reales (potenciales):
PyQt solo está disponible bajo la GPL. Esto significa que si publica su código, debe estar disponible bajo una licencia compatible, bajo los términos de la Excepción GPL de Nokia o bajo una licencia comercial (que cuesta dinero). Esto contrasta con Qt, que ahora está disponible bajo la LGPL.
PyQt no se incluye de forma predeterminada con las instalaciones de Python. Vas a tener que empaquetar la biblioteca tú mismo. (Ars Technica tiene un buen artículo sobre cómo hacerlo para Windows y OS X.)