Recuerdo que el Prefijo una vez se inventó, porque muchos proveedores de alojamiento solo admitían una Base de datos por usuario, por lo que se necesitaban muchas aplicaciones para compartir una base de datos y podrían surgir conflictos. Además, el prefijo le permitió instalar más de un magento en la misma base de datos.
Pero, ¿todavía hay una razón para ellos hoy que no veo? Incluso en un proveedor de alojamiento gratuito obtienes suficientes bases de datos como lo que sé.