Puede intentar cambiar su código para usar una buena combinación de getChilderCategories () y la función toArray.
$category = Mage::getModel('catalog/category')->load(3);
$subCats = $category->getChildrenCategories();
$subCatIds = $subCats->toArray(array('entity_id'));
La función getChildrenCategories le dará una colección en el mismo orden que la sección de administración y luego llamando a Array y solo preguntando por el atributo derechos_id tendrá una matriz de identificadores de categoría
array(3) {
[10]=> array(1) {
["entity_id"]=> string(2) "10"
}
[13]=> array(1) {
["entity_id"]=> string(2) "13"
}
[18]=> array(1) {
["entity_id"]=> string(2) "18"
}
}
$subCats = Mage::getModel('catalog/category')->load($category->getId())->getChildren();
? ¡Gracias!