configuración de magento: la actualización es más o menos el equivalente de n98-magerun sys: configuración: se ejecuta en magento 1 en el sentido de que ejecuta sus scripts de configuración pero hace algo adicional a eso en magento 2 desde 2.1 si no me equivoco. Activa tus módulos recién creados. Será necesario ejecutarlo en modo desarrollador, así como en modo producción y predeterminado. setup: di: compile por otro lado genera tus clases "autogeneradas" y solo necesitará ejecutarse en modo producción ya que esto se hace automáticamente en modo desarrollador.
También sobre la indexación , no es necesario hacer eso a menos que tenga habilitado tablas planas y ha realizado un cambio a una de las entidades que se ven afectados por los índices, por ejemplo, atributos de productos, atributos de categoría, categoría de productos, etc borrar la memoria caché shouldn' En teoría, es necesario ejecutarlo si las memorias caché están deshabilitadas, pero lo hago todo el tiempo para verificar la cordura, tenga en cuenta que la actualización de la configuración también borra las memorias caché.
Espero que esto responda tu pregunta.