Cuando se actualiza Joomla core, no se verán afectadas las anulaciones en su carpeta de plantillas. Por eso existen.
En los elementos principales de Joomla, las anulaciones rara vez entrarán en conflicto con las actualizaciones principales de Joomla. Cuando anula los archivos principales de Joomla, o cualquier archivo, documento documento documento. Comentar en el archivo de anulación es CRÍTICO si esto te va a pasar regularmente y administras más de uno o dos sitios. ¡Simplemente no recordarás lo que cambiaste!
Su editor de código debe tener una función "diff", para comparar el nuevo archivo con el anterior e identificar línea por línea los cambios realizados. Si ha comentado bien, esta diferencia le mostrará exactamente qué se modificó y si el archivo se vio afectado por la actualización. Sus únicos cambios deben ser sus anulaciones ... cualquier otra cosa y usted tiene que ir y volver a anular.
Sin embargo, las anulaciones de terceros se convierten en un problema solo si el desarrollador no está utilizando la estructura MVC correctamente. Si un componente o módulo se presenta adecuadamente, el tmpl o la vista en cuestión no deberían verse afectados por las actualizaciones de código.
Si hay un cambio importante en las características de esa extensión, definitivamente necesitará documentar / comentar y comparar archivos.