Definitivamente puede eliminar los archivos en el directorio tmp y, de hecho, se recomienda hacerlo y mantenerlo limpio. Solo debe mantener el archivo index.html en su lugar, ya que puede evitar la posible inclusión en el directorio de los archivos.
Joomla y sus extensiones utilizan la carpeta tmp (temporal) cuando realiza instalaciones de software o cuando el sistema maneja archivos y necesita una ubicación para almacenarlos temporalmente. En muchos casos, estos archivos se atascan en la carpeta tmp. Aparentemente, esto puede dar lugar a problemas de espacio en HD, pero también existe otro riesgo mayor.
Dado que estos archivos pueden provenir de extensiones antiguas una vez instaladas en su sitio web, pueden contener código antiguo vulnerable e inseguro. También pueden ser cualquier tipo de archivos php ejecutables, o pueden contener otra información confidencial que puede estar expuesta.
Aunque sus otras configuraciones de seguridad y la configuración de su servidor pueden ser una salvaguarda, la mejor práctica es eliminar dichos archivos y mantener limpio su sitio web, algo que debe realizar periódicamente.
Como se mencionó anteriormente, solo debe conservar el archivo index.html. Para una mayor seguridad, también puede colocar un archivo .htaccess con reglas para evitar el acceso web a la carpeta.
Acerca de los permisos de directorio tmp.
Como se dijo, el sistema Joomla utiliza la carpeta tmp durante la instalación. Es una situación común cuando los permisos insuficientes o una entrada incorrecta en la configuración de la ruta del directorio tmp provocará un error en las instalaciones. En tal caso, asegúrese de haber configurado correctamente la ruta en el archivo de configuración para el directorio tmp y que tenga permisos suficientes.
Limpieza automática del directorio tmp
Para un proceso automatizado de limpieza automática de la carpeta tmp junto con la sugerencia de Lodder para las Herramientas de administración de Akeeba, recomendaría el complemento Limpiador de caché de NoNumber que también proporciona una configuración especial para la carpeta tmp.