Como se pregunta "por qué se perciben de manera diferente", aquí hay otra cosa (muy geek) a considerar: la luminiscencia percibida de un color RGB. Esto es difícil de aplicar, así que toma mi respuesta casi como una trivia:)
El valor de luminiscencia de un color indica qué tan "iluminado" lo percibes. Si el color fuera una bombilla, un color con baja luminiscencia se percibiría como tenue (bombilla de 40W), mientras que un color con alta luminiscencia se percibiría como muy brillante (bombilla de 100W).
De hecho, los colores RGB se muestran con pequeñas "bombillas". Las pantallas están formadas por pequeñas "bombillas", tres por cada píxel: R (ed), G (reen) y B (lue). Los valores específicos R, G y B de un color indican qué tan brillante debe encenderse cada pequeña bombilla para crear la ilusión de ese color. Por ejemplo, el color naranja RGB (255, 100, 0) se crea girando la bombilla roja a su máxima potencia (255), haciendo que la bombilla verde se oscurezca (100) y apague la bombilla azul (0).
Aquí hay una ilustración que muestra algunos colores y qué tan "brillante" debe hacerse cada uno de los componentes RGB para crear la ilusión del color. Los pequeños puntos debajo de cada color indican qué tan oscuro o brillante se hace el componente.
Como puede ver en la ilustración, para crear blanco, por ejemplo, gira los 3 componentes al máximo (255). Esta combinación de las 3 pequeñas "bombillas" es percibida por el ojo como blanca (explicando por qué sería una gran digresión). Para crear negro, apaga todos. Eso es fácil: sin luz ni color.
La luminiscencia de cada color se calcula agregando "cuán brillante" son cada uno de los 3 componentes. El blanco sería el color con mayor luminiscencia, ya que los 3 componentes se convierten en su valor máximo. Negro, sería el que tenga el más bajo. El amarillo tendría una luminiscencia más alta que el verde ya que para hacer el amarillo necesitas 2 componentes al máximo, pero para hacer el verde solo necesitas uno. Entonces, más o menos se podría decir que
L = R + G + B
Sin embargo, es un poco más complicado. Al observar la ilustración, notará que el componente verde parece ser más brillante. De hecho, es percibido por el ojo como el más brillante. Azul, por otro lado, se percibe como muy tenue. La fórmula exacta para calcular la luminiscencia lo tiene en cuenta.
L = 0.2126 R + 0.7152 G + 0.0722 B
Aquí está la ilustración nuevamente, con la luminiscencia calculada para cada color.
Notarás que, como te podría haber dicho tu ojo, el amarillo es más luminoso que el naranja, pero el naranja es más o menos tan luminoso como el magenta.
Ahora, tomé los colores de dos de sus paletas originales y calculé su luminiscencia.
En el primer caso, el que le guste, notará que la luminiscencia del primer color, en la parte inferior, es más baja (125) que la del segundo color, en la parte superior (200). El gradiente, entonces, se percibe como un aumento en la luminosidad, como si se estuviera iluminando.
En el segundo caso, no hay mucha diferencia, por lo que el gradiente se percibe solo como un cambio en el tono.
En el tercer caso, el color inferior tiene una luminiscencia más alta que el superior, por lo que el gradiente se percibe como una disminución de la luminosidad, como si se atenuara.
Esto explicaría por qué, incluso cuando selecciona 2 tonos que se colocan relativamente a la misma distancia entre sí en la rueda de colores que los que le gustan, el resultado se percibiría de manera diferente.