Esta pregunta es interesante. Sinceramente, nunca he oído hablar de un número limitado de tamaños de fuente. Sin embargo, he oído hablar de la cantidad de caras de fuente que generalmente no exceden de 2 o 3. En la web receptiva de hoy, verá que los tamaños de fuente cambian todo el tiempo dependiendo de la ventana gráfica.
Esta no sería una buena respuesta sin algunas fuentes, por lo que hay dos artículos interesantes que creo que deberías leer de Smashing Magazine. Una es sobre las pautas y técnicas de tipografía (lo he vinculado a la sección en la que hablan sobre escalar las etiquetas de encabezado en términos relativos) h1: 1.5ems, h2: 1.375ems, etc.
El segundo artículo es un gran estudio que Smashing Magazine hace sobre tipografía todos los años en algunos de los sitios más populares de la web. Estos sitios se basan principalmente en el contenido, por lo que la tipografía es de vital importancia para ellos.
Sin embargo, creo que lo que encontrará es que no hay ninguna práctica recomendada en general para los tamaños de fuente. Siempre que no cambien drásticamente para distraer al espectador, puedes jugar con ellos a tu discreción. Si puede usar los tamaños de fuente de una manera distinguible para que el usuario pueda relacionar un tamaño de fuente con un tipo de contenido en particular, entonces debería estar bien. Simplemente no te vayas por la borda.