En primer lugar, gracias por todas las respuestas y comentarios. Desafortunadamente, las herramientas existentes no eran totalmente compatibles con las últimas versiones de QGIS y ArcGIS. Por lo tanto, hice mi propia solución utilizando la herramienta indicada por @polygeo, el complemento QGIS de @Alexandre y el nombre del algoritmo (mapa de cuatro colores) de @Jens.
Aquí está mi código para los interesados (para ArcGIS, pero la segunda parte también podría usarse en QGIS).
arcpy.MakeFeatureLayer_management(fc, fc[:-4]+ "_lyr" )
try:
arcpy.AddField_management(fc[:-4] + "_lyr", "color", "SHORT")
except:
print "field alread exists"
arcpy.CalculateField_management(fc[:-4] + "_lyr", "color", "10" , "PYTHON")
arcpy.PolygonNeighbors_analysis(fc[:-4] + "_lyr", fc[:-4] + "_tb.dbf" )
graph = []
cursor=arcpy.da.SearchCursor( fc[:-4] + "_tb.dbf" , ("src_FID","nbr_FID") )
for row in cursor:
graph.append(row)
pols = arcpy.da.UpdateCursor(fc[:-4] + "_lyr", ("OID@","color"))
colored = []
for pol in pols:
nbrs = [ second for first, second in graph if first == pol[0]]
usedcolors = []
for nbr in nbrs:
usedcolors += [second for first, second in colored if first == nbr]
pol[1]=[color for color in range(10) if color not in usedcolors][0]
colored.append(pol)
pols.updateRow(pol)
Tenga en cuenta que el algoritmo no garantiza que solo se usen 4 colores: aunque se ha demostrado que la solución existe, la "fuerza bruta" es necesaria para lograrlo. En mi caso, obtuve 7 colores que son lo suficientemente pequeños. El script podría tener un bucle adicional hasta que se encuentre la solución, pero necesito hacerlo para cientos de mapas y 7 colores está bien.