Respuestas:
Sextante es una biblioteca de geoprocesamiento que se puede utilizar desde varias aplicaciones SIG. Le recomiendo que lo use desde gvSIG ya que creo que tiene la mejor integración. Sextante también permite (si lo configura correctamente) usar algoritmos de SAGA y GRASS.
Aquí puede ver un video que muestra cómo funciona el modelador .
Actualización: a partir de marzo, qgis también tiene un complemento Sextante que funciona muy bien.
GRASS tiene un generador de modelos que funciona bastante bien (no sé cómo se compara con Arc * one).
Victor Olaya, el desarrollador de Sextante está trabajando actualmente en Sextante para QGIS . Es un trabajo en progreso y aún no está listo para su uso en producción, así que úselo con cuidado. Puede ver una breve demostración del creador de modelos Sextante aquí: http://www.youtube.com/watch?v=LTUu-I2ouqU
Actualización de noviembre de 2012 : Sextante para QGIS se está desarrollando muy bien, como puede ver, por ejemplo. en este nuevo estudio de caso: http://www.qgis.org/en/community/qgis-case-studies/pinhel-portugal.html
Actualización de enero de 2016 : Sextante es ahora un complemento principal en las versiones recientes de QGIS y se llama Procesamiento. Consulte más información sobre en el Manual de usuario de QGIS - Marco de procesamiento de QGIS . También puede obtener información sobre cómo usar el Modelador gráfico aquí .
Me complace informarles que actualmente estamos trabajando en SEXTANTE para QGIS. Debería estar listo pronto e incluirá el modelador, que es lo que está solicitando.
También puede considerar algunos scripts básicos de Python para ejecutar múltiples comandos en serie.