Leer, modificar y escribir un geotiff con GDAL en python

Estoy tratando de aprender las cuerdas del procesamiento de imágenes de detección remota utilizando enlaces Python GDAL y numpy. Como primer intento, estoy leyendo un archivo geotiff Landsat8, hago una simple manipulación y escribo el resultado en un nuevo archivo. El siguiente código parece funcionar bien, excepto que el ráster original se volca en el archivo de salida, en lugar del ráster manipulado.

Cualquier comentario o sugerencia son bienvenidos, pero particularmente notas sobre por qué el ráster manipulado no se muestra en el resultado.

import os
import gdal

gdal.AllRegister()

file = "c:\~\LC81980242015071LGN00.tiff"
(fileRoot, fileExt) = os.path.splitext(file)
outFileName = fileRoot + "_mod" + fileExt

ds = gdal.Open(file)
band = ds.GetRasterBand(1)
arr = band.ReadAsArray()

[cols, rows] = arr.shape
arr_min = arr.Min()
arr_max = arr.Max()
arr_mean = int(arr.mean())

arr_out = numpy.where((arr < arr_mean), 10000, arr)

driver = gdal.GetDriverByName("GTiff")
outdata = driver.Create(outFileName, rows, cols, 1, gdal.GDT_UInt16)
outband = outdata.GetRasterBand(1)
outband.WriteArray(arr_out)
outdata = None

print arr_min
> 0
print arr_max
> 65535
print arr_mean
> 4856

Yo uso Python 2.7.1 en una máquina con Windows 7 de 32 bits.

A su script le falta el método ds.FlushCache, que guarda en el disco lo que tiene en la memoria al final de las modificaciones. Vea a continuación una versión corregida de su ejemplo. Tenga en cuenta que también agregué dos líneas para establecer la proyección y la geotransformación como entrada

import os
import gdal

file = "path+filename"
ds = gdal.Open(file)
band = ds.GetRasterBand(1)
arr = band.ReadAsArray()
[cols, rows] = arr.shape
arr_min = arr.min()
arr_max = arr.max()
arr_mean = int(arr.mean())
arr_out = numpy.where((arr < arr_mean), 10000, arr)
driver = gdal.GetDriverByName("GTiff")
outdata = driver.Create(outFileName, rows, cols, 1, gdal.GDT_UInt16)
outdata.SetGeoTransform(ds.GetGeoTransform())##sets same geotransform as input
outdata.SetProjection(ds.GetProjection())##sets same projection as input
outdata.GetRasterBand(1).WriteArray(arr_out)
outdata.GetRasterBand(1).SetNoDataValue(10000)##if you want these values transparent
outdata.FlushCache() ##saves to disk!!
outdata = None
band=None
ds=None