Muchas gracias a @whuber por la respuesta inicial. pensé que debería subir los resultados de mí haciendo lo mismo ...
Por lo que vale, la forma particular de MDS que utilicé es algo llamado t-SNE (también conocido como 'Incrustación estocástica de Neihbor t-distribuido' ) para lograr las siguientes imágenes.
Aquí hay una imagen de todas las ciudades en orden: en el eje izquierdo se encuentra la ubicación 1-d real para esa ciudad, y las ciudades ordenadas de arriba a abajo, de izquierda a derecha en ese eje. Color = país
Aquí hay otra foto donde tomé la línea de ciudades pero la tracé en el mapa mundial. Supongo que este problema se reduce a algo bastante cercano al problema del vendedor ambulante, pero con la diferencia de que no es solo un pedido de ciudades sino un mapeo de ciudades a una línea 1-d ...
Si alguien quiere los datos de salida completos o la metodología utilizada aquí, envíeme un mensaje.
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En respuesta al comentario de @ whuber ..
Sí, tiene razón cuando enfatiza la distancia local (es decir, que las distancias locales de los vecinos inmediatos deben estar lo más cerca posible de las distancias reales en el mapa mundial), el problema MDS se reduce al problema del vendedor ambulante. Sin embargo, si enfatiza la optimización (o coincidencia) de distancias en un rango más amplio / moderado, puede obtener resultados diferentes. Por ejemplo, esto es lo que da el algoritmo t-sne cuando usa un valor más alto para 'perplejidad':