Use lo que sea más conveniente para usted. No importa en qué unidades se definan los paquetes porque cualquier software decente desacopla las definiciones de paquetes de las dimensiones de diseño y enrutamiento de todos modos. Use cualquier métrica que use la hoja de datos cuando defina la huella del paquete, ya que eso minimizará los errores. Incluso entonces, cambio de nuevo a pulgadas al definir las capas de serigrafía y documentación porque eso es con lo que puedo relacionarme más directamente.
Para el diseño y enrutamiento, use lo que le resulte más cómodo. Aprendí estas cosas pensando en pulgadas y milésimas de pulgada, así que eso es lo que uso. Puedo imaginar 8 mils en mi cabeza, pero tendría que convertir el equivalente en mm para obtener una imagen mental. Para eso están las computadoras. Son muy buenos para multiplicar o dividir por 25.4, así que permítales servirle a usted, no al revés.
Al exportar archivos a una casa de juntas, usaría pulgadas. Eso parece ser más del estándar universal, probablemente debido a la historia. Las computadoras de la casa de juntas también pueden multiplicarse por 25.4, por lo que las casas de juntas que usan mm internamente no se molestarán. Hace unos años, algunas casas de juntas querían todas las entradas en pulgadas, pero sospecho que hoy ya no es así.