He usado esta técnica antes (en 4 capas, no en 2, pero aún se mantiene), y encontré varias ventajas y desventajas de hacerlo. De lo que están hablando específicamente es de una isla de plano de tierra que no es GND, sino AGND, que está vinculada a GND en un solo punto, posiblemente a través de una pequeña impedancia. No estoy seguro si el ATMEL tiene un pin AGND separado, pero nuestro dsPIC sí. En este caso no hay conexión sino un inductor entre VCC y AVCC, y la derivación nunca debe cruzar de VCC a AGND, o AVCC a GND. Todas las señales analógicas están referenciadas a AGND (es decir, divisores de voltaje, tapas antisolapamiento, etc.). El objetivo es evitar que todos los circuitos digitales que crean ruido ensucian sus rieles analógicos.
En cuanto a la implementación de su técnica, solo están diciendo que la extensión de esta isla AGND abarcaría aproximadamente esta esquina del micro, así como todas las derivaciones entre AVCC y AGND y sus circuitos de medición analógicos. No tiene que extenderse completamente a los puertos de entrada para mediciones de voltaje, etc., sino al menos a la resistencia del lado bajo de su divisor de voltaje y tapa antialiasing, así como a cualquier amplificador de entrada analógica y sus fuentes de alimentación. Por AVCC, me refiero al VCC después de ser filtrado por el inductor.
Experimentamos con diferentes impedancias que conectaban GND y AGND, y descubrimos que una resistencia de 10 ohmios funcionaba bien para aislar el ruido en la tierra digital. Si la impedancia es demasiado alta, el micro no estará contento porque espera el mismo potencial de CC en los dos motivos. En nuestro caso, teníamos un LDO de bajo ruido separado que alimentaba el AVDD, y un convertidor buck ruidoso y de alta potencia que alimentaba los muchos dispositivos en el VDD digital. El aislamiento que lograría (para evitar que las cosas digitales ruidosas contaminen sus rieles analógicos) es menor con solo un inductor y una isla de tierra separada como sugiere esta hoja de datos, pero es mucho más simple de implementar.
Una prueba simple para verificar si está mejorando su ruido de riel analógico es usar su ADC para convertir un valor de CC y trazar las mediciones sin procesar en un histograma o hacer un stdev en Excel. En un mundo perfecto / sin ruido, no tendría variación en esta medición, pero en el mundo real tiene una cierta cantidad de variación proporcional a sus niveles de ruido.