Un problema con el que nos topamos en Drupal 7 es cuando tienes muchos nodos que obtendrían el mismo alias de ruta. Porque lo que sucede es que el primero obtiene $ alias, el segundo prueba $ alias, ve que este ya está reservado y usa $ alias-1. El tercero prueba $ alias, luego $ alias-1 y luego usa $ alias-2. Y así. Sin embargo, ese no es el problema de Pathauto y no es realmente un error, ya que deberías limpiar tus datos malos (teníamos 600k artículos impresos importados con cientos de títulos iguales ... como "clima";)) o elegir un mejor patrón para tu alias (por ejemplo, incluir la fecha). Esto también puede ralentizar seriamente la importación de datos si tiene habilitado Pathauto.
Otro problema es que el navegador de tokens explota si tiene muchos campos que pueden romper por completo cualquier página que enumere un navegador de tokens, especialmente el sitio de configuración de pathauto que tiene varios de esos.
Aparte de esos problemas relacionados, no he visto ningún problema de rendimiento directo causado por Pathauto. Si cree que lo hace, lo que realmente debería hacer es perfilar su sitio con Xhprof para ver qué está usando realmente la CPU / memoria.