Deberías poder correr mysql_install_db
desde la línea de comando
mysql_install_db inicializa el directorio de datos MySQL y crea las tablas del sistema que contiene, si no existen. También inicializa el espacio de tabla del sistema y las estructuras de datos relacionadas necesarias para administrar las tablas de InnoDB. A partir de MySQL 5.6.8, mysql_install_db es un script de Perl y se puede usar en cualquier sistema con Perl instalado. Antes de 5.6.8, es un script de shell y está disponible solo en plataformas Unix.
Lea la documentación de MySQL completa paramysql_install_db
, luego ...
DARLE UNA OPORTUNIDAD !!!
Si no funciona en el primer intento, haz esto
mkdir /var/lib/mysql
mkdir /var/lib/mysql/mysql
chown -R mysql:mysql /var/lib/mysql
luego corre de mysql_install_db
nuevo