Primero, no estoy convencido de que los motores sean necesariamente débiles sin sus libros. Sin un libro de apertura, los motores modernos podrían no jugar la mayoría de las líneas de prueba, o las líneas que los llevarían a una posición donde prosperan, pero cualquier motor superior aún aplastará a cualquier GM humano sin un libro de apertura.
Como comentario interesante, si dejas el motor encendido por un tiempo, generalmente encuentra a los Cuatro Caballeros españoles como la mejor línea desde la posición inicial, pero estoy divagando ...
En el juego final, depende totalmente del motor y la posición. Sin bases de tablas, los motores podrían no saber que un peón de torre y un alfil equivocado es solo un empate. Si los programadores agregaron esa excepción, entonces lo resolverán, pero de lo contrario, podrían cambiar pensando que ganarán con un alfil extra y un peón solo para sacar a través de la regla de 50 movimientos.
En finales finales más elementales, como KBNvK, el lado más fuerte casi siempre ganará. La secuencia de apareamiento más larga es de 33 movimientos si mi memoria sirve. La mayoría de los motores tropezarán con un compañero forzado en ese momento porque sus heurísticas les harán hacer buenos movimientos que se acerquen al compañero (y probablemente puedan ver 15-20 movimientos de profundidad).
En términos de KQvKR, el lado más fuerte casi siempre ganará contra un humano. Los humanos son bastante malos defendiendo esta posición, y la computadora verá instantáneamente formas de eliminar una torre suelta. Contra otra computadora, es un poco más difícil, pero como dice Wes en su respuesta, todavía es probable que gane el lado más fuerte (la maniobra de Philidor es de solo ~ 5 movimientos de largo, lo suficientemente corto como para que el motor lo vea) dado tiempo suficiente.