Esto se puede hacer en stock Mail.app, pero requiere algunos pasos.
Primero, vaya a Correo » Preferencias ... y en la pestaña General , configure Sonido de mensajes nuevos: en Ninguno .

Luego, haga clic en la pestaña Reglas .
Crea una nueva regla.
En la descripción, escriba Sound
.
Establezca la regla para aplicar si se cumplen todas las condiciones.
Para cualquier tema que no quiero sonar el sonido de nuevos mensajes, introducir el contenido de su línea de asunto (no el Fwd: Re: o partes) en el campo de Asunto entonces no contiene .
Para la acción , configure Reproducir sonido en Sonido de mensajes nuevos .

Siempre que desee agregar un hilo a la lista de exclusión, agregue una condición.
Si agrega hilos a esta lista con frecuencia, este proceso puede ser programado, pero escribir ese guión sería otra pregunta (que puede publicar si desea seguir esta ruta).