No hay respuestas realmente fáciles para esto. Dependerá de la cantidad de memoria que tenga su sistema, cuáles son las aplicaciones, qué tan bien están escritas, etc.
Por ejemplo, si tiene una pequeña cantidad de memoria y la comprobación del Monitor de actividad muestra poca memoria disponible o se está utilizando mucho espacio de intercambio. Entonces, probablemente desee asegurarse de que las aplicaciones se cierren para que haya más memoria disponible. Además de lo confuso en torno a esto, está el hecho de que, aunque salga de una aplicación, OS X no la elimina de la memoria hasta que necesite espacio para otra cosa. Es por esto que salir y volver a abrir una aplicación es más rápido que la primera vez que la inició. Si la aplicación todavía está en la memoria, OS X solo tiene que iniciarla nuevamente. Por supuesto, en una situación de poca memoria, OS X elimina automáticamente las aplicaciones de la memoria que se han cerrado para que la memoria pueda estar disponible para otra cosa.
Las aplicaciones para las que cerró todas las ventanas, pero no se cerraron, pueden afectar el sistema. Depende de lo que hagan. Entonces, la memoria, la CPU y la batería se pueden consumir. Una vez más, Activity Monitor es su amigo para determinar si alguna de sus aplicaciones está causando problemas.
En términos generales, si tiene suficiente memoria y sus aplicaciones se comportan bien en términos de succionar la batería, no importa si cierra o cierra. Afortunadamente, las aplicaciones OS X generalmente se comportan bastante bien.