Para el registro, estamos hablando de esto:
El problema es que OS X no recuerda si desmarca la casilla de verificación en el último apagado; siempre mantendrá la casilla de verificación marcada de forma predeterminada en los cierres posteriores.
Encontré dos soluciones diferentes para este problema , que parecen funcionar, aunque no son ideales.
Abra Terminal.app e ingrese los siguientes comandos:
defaults write com.apple.loginwindow TALLogoutSavesState -bool false
defaults write com.apple.loginwindow LoginwindowLaunchesRelaunchApps -bool false
Esto deshabilita efectivamente la opción "reabrir ventanas al volver a iniciar sesión", aunque la casilla de verificación seguirá estando marcada. Puedes ignorarlo.
Me temo que no hay una solución mejor, al menos no por el momento.
Actualización: OS X 10.7.4 solucionó esto; ahora recuerda su selección: