Asegúrese de que está creando carpetas que se almacenan en Gmail utilizando IMAP.
Parece que está moviendo los mensajes a una carpeta local (en mi mac) y el comportamiento correcto en ese caso es eliminar el mensaje de todas las carpetas IMAP.
Mail mantiene una copia local de todos los mensajes, por lo que aún tiene acceso sin conexión, las copias de seguridad de Time Machine se remontan en el tiempo y todos los beneficios del almacenamiento local cuando los mensajes se "almacenan en una carpeta en Gmail". Piense en la ubicación como la copia autorizada y no la única copia o incluso la copia más correcta. Cuando realiza cambios sin conexión, esas marcas de tiempo permiten que el sistema vuelva a sincronizar sus cambios con gmail una vez que vuelva a conectarse e integre correctamente los cambios con el correo nuevo que haya recibido sin conexión.
Solo para ser totalmente claros, aquí hay algunas fotos ...
Intente crear una nueva carpeta IMAP como la que se muestra a continuación: puede cambiarle el nombre más tarde si es necesario para ver cómo se ve la creación de una carpeta almacenada en Gmail en su cliente de correo.
No quieres que se almacene localmente así:
Puede arrastrar mensajes a la nueva carpeta o arrastrar estructuras de carpetas completas siempre que tenga tiempo para que la operación sincronice / cargue todos los datos en los servidores de Gmail. He visto carpetas con 5,000 mensajes que tardan dos o tres horas en cargarse, incluso en Internet normal, con velocidades de carga decentes, así que intente primero con buzones más pequeños para entender el problema.