Respuestas:
Command+ Wno oculta las aplicaciones; cierra la ventana activa actual. Es por eso que no puedes mostrarlos usando Command+ Tab, porque la ventana ya no existe.
Puede ocultar la aplicación usando Command+ H. Este acceso directo no cerrará la ventana, por lo que puede recuperar todas las ventanas ocultas de una aplicación utilizando Command+ Taby seleccionando la aplicación.