En Yosemite, inicialmente, tenía instalado cuarzo y gunplot 5.0.0. Sin embargo, no pude cargar mi ventana x11 (todo lo demás era file-X11 era de alguna manera desconocido). Aquí hay una solución que "funcionó para mí".
Ir a la carpeta fuente de gunplot
make clean;
make uninstall
luego en el archivo "configurar" bajo las siguientes líneas
# Standard set of common directories for X headers.
# Check X11 before X11Rn because it is often a symlink to the current release.
---added the location of my X11 files also
/opt/X11/include
ahora corre
./configure
make
sudo make install
funcionó perfectamente para mí como ves a continuación
G N U P L O T
Version 5.0 patchlevel 0 last modified 2015-01-01
Copyright (C) 1986-1993, 1998, 2004, 2007-2015
Thomas Williams, Colin Kelley and many others
gnuplot home: http://www.gnuplot.info
faq, bugs, etc: type "help FAQ"
immediate help: type "help" (plot window: hit 'h')
Tipo de terminal set to 'x11'
.