Ciencia computacional

¿Alguien tiene recomendaciones sobre una biblioteca de matriz de C ++ rápida y utilizable? Lo que quiero decir con usable es lo siguiente: Los objetos de matriz tienen una interfaz intuitiva (por ejemplo: puedo usar filas y columnas mientras indexo) Puedo hacer cualquier cosa con la clase de matriz que …

158 linear-algebra  software  implicit-methods 

Estoy firmemente convencido del valor de usar pruebas que verifiquen un programa completo (por ejemplo, pruebas de convergencia), incluido un conjunto automatizado de pruebas de regresión . Después de leer algunos libros de programación, tengo la sensación de que "debo" escribir pruebas unitarias (es decir, pruebas que verifican la corrección …

89 programming-paradigms  testing 

Así que tengo una cabeza decente con respecto a qué problemas con los que trabajo son los mejores en serie, y cuáles se pueden manejar en paralelo. Pero en este momento, no tengo mucha idea de lo que se maneja mejor con el cómputo basado en la CPU, y qué …

84 gpu 

Tengo que resolver varios problemas desafiantes de optimización global no convexo. Actualmente uso la Caja de herramientas de optimización de MATLAB (específicamente, fmincon()con algoritmo = 'sqp'), que es bastante eficaz . Sin embargo, la mayor parte de mi código está en Python, y me encantaría hacer la optimización también en …

77 python  optimization  nonlinear-programming  linear-algebra  linear-solver  sparse-matrix  ode  automatic-differentiation  efficiency  matrix  symbolic-computation  pde  multiphysics  operator-splitting  fluid-dynamics  pde  multigrid  pde  hyperbolic-pde  quadrature  precision  numerical-analysis  fluid-dynamics  interpolation  c  ode  testing  data-sets  pde  fluid-dynamics  hyperbolic-pde  pde  finite-element  fluid-dynamics  stability  incompressible  pde  hyperbolic-pde  fluid-dynamics  pde  precision  floating-point  convex-optimization  conditioning  pde  hyperbolic-pde  stability  implicit-methods  explicit-methods  fluid-dynamics  accuracy  pde  hyperbolic-pde  petsc  linear-algebra 

Esta pregunta es una extensión de dos discusiones que surgieron recientemente en las respuestas a " C ++ vs Fortran for HPC ". Y es un poco más un desafío que una pregunta ... Uno de los argumentos más escuchados a favor de Fortran es que los compiladores son simplemente …

74 fortran  c  blas  benchmarking 

Trabajo en ciencias computacionales y, como resultado, paso una cantidad no trivial de mi tiempo tratando de aumentar el rendimiento científico de muchos códigos, así como de comprender la eficiencia de estos códigos. Supongamos que he evaluado el rendimiento en comparación con la legibilidad / reutilización / mantenibilidad del software …

66 performance 

En mi programa de doctorado en ciencias computacionales, estamos trabajando casi exclusivamente en C ++ y Fortran. Parece que algunos profesores prefieren uno sobre el otro. Me pregunto cuál es 'mejor' o si uno es mejor que el otro en ciertas circunstancias.

56 hpc  fortran  c++  languages 

The Fast Fourier Transform algoritmo calcula un Fourier descomposición bajo el supuesto de que sus puntos de entrada son equidistantes en el dominio del tiempo, . ¿Y si no lo son? ¿Hay otro algoritmo que podría usar, o de alguna manera podría modificar la FFT, para dar cuenta de lo …

55 fourier-analysis 

Estoy considerando aprender un nuevo lenguaje para usar en proyectos de modelado numérico / simulación, como un reemplazo (parcial) para C ++ y Python que uso actualmente. Me encontré con Julia , que suena un poco perfecta. Si hace todo lo que dice, podría usarlo para reemplazar C ++ y …

55 parallel-computing  languages  julia 

Muchos algoritmos numéricos (integración, diferenciación, interpolación, funciones especiales, etc.) están disponibles en bibliotecas de computación científica como GSL . Pero a menudo veo código con implementaciones "enrolladas a mano" de estas funciones. Para los programas pequeños que no están destinados necesariamente a la distribución pública, ¿es una práctica común entre …

54 libraries  c 

Todo científico necesita saber un poco sobre estadísticas: qué significa correlación, qué es un intervalo de confianza, etc. Del mismo modo, todo científico debería saber un poco sobre informática: la pregunta es, ¿qué? ¿Qué es razonable esperar que todo científico que trabaja sepa sobre la construcción y el uso de …

52 education 

Los sistemas lineales dispersos aparecen con frecuencia creciente en las aplicaciones. Uno tiene muchas rutinas para elegir para resolver estos sistemas. En el nivel más alto, existe una línea divisoria entre los métodos directos (p. Ej., Eliminación gaussiana escasa o descomposición de Cholesky, con algoritmos de ordenamiento especiales y métodos …

49 linear-algebra  linear-solver  sparse-matrix 

Hay una diferencia obvia entre la diferencia finita y el método de volumen finito (pasando de la definición puntual de las ecuaciones a los promedios integrales sobre las celdas). Pero encuentro que FEM y FVM son muy similares; ambos usan forma integral y promedio sobre las celdas. ¿Qué está haciendo …

48 finite-element  finite-volume 

Estoy acostumbrado a pensar en las diferencias finitas como un caso especial de elementos finitos, en una cuadrícula muy restringida. Entonces, ¿cuáles son las condiciones sobre cómo elegir entre el Método de diferencia finita (FDM) y el Método de elementos finitos (FEM) como método numérico? Del lado del Método de …

46 pde  finite-element 

Muchas veces, cuando heredé o me encontré con un código científico escrito por otras personas (u ocasionalmente, incluso con mi propio trabajo), noté que la documentación es escasa o inexistente. Si tengo suerte, veo comentarios informativos. Si tengo mucha suerte, incluso hay comentarios de Doxygen y un Doxyfile para que …

44 software  documentation